Ngày 01 tháng 03 năm 2016, Văn Phòng Công nhận Chất lượng (Bộ Khoa học và Công nghệ) đã công nhận Trung tâm Chất lượng nông lâm thủy sản vùng 6 là Tổ chức chứng nhận hệ thống quản lý an toàn thực phẩm (số hiệu: VICAS 050-MSFS) và là Tổ chức chứng nhận sản phẩm (số hiệu: VICAS 050-PRO)

Ngày 30/12/2022, Bộ Nông nghiệp và Phát triển nông thôn ban hành Thông tư số 32/2022/TT-BNNPTNT về việc sửa đổi, bổ sung một số Thông tư quy định thẩm định, chứng nhận cơ sở sản xuất, kinh doanh thực phẩm nông, lâm, thủy sản đủ điều kiện bảo đảm an toàn thực phẩm thuộc phạm vi quản lý của Bộ Nông nghiệp và Phát triển nông thôn.